Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms