Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SardhQ99LB7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms