Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Card11Q8CIS0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Card11Q8CIS0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms