Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zbtb40Q6PCS8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms