Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mre11Q61216 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mre11Q61216 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mre11Q61216 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mre11Q61216 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mre11Q61216 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mre11Q61216 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mre11Q61216 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mre11Q61216 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mre11Q61216 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mre11Q61216 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mre11Q61216 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mre11Q61216 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mre11Q61216 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mre11Q61216 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mre11Q61216 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mre11Q61216 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mre11Q61216 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mre11Q61216 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mre11Q61216 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mre11Q61216 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mre11Q61216 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mre11Q61216 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mre11Q61216 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mre11Q61216 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mre11Q61216 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mre11Q61216 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms