Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms