Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms