Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam228bQ497Q6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms