Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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