Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms