Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms