Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn6Q03958 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms