Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga1P29974 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms