Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf5O35326 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srsf5O35326 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms