Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbip1J3QMK2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms