Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20425E9Q035 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20425E9Q035 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms