Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd4A2AKM2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hacd4A2AKM2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd4A2AKM2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms