Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700019A02RikA0A087WPV9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms