Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Extl1Q9JKV7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms