Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms