Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stx12Q9ER00 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms