Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gps1Q99LD4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gps1Q99LD4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms