Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI36

Jkamp, JNK1/MAPK8-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JkampQ8BI36 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JkampQ8BI36 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JkampQ8BI36 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms