Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdc1Q5PSV9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms