Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrmoQ562D6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrmoQ562D6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TrmoQ562D6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrmoQ562D6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TrmoQ562D6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrmoQ562D6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrmoQ562D6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrmoQ562D6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrmoQ562D6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TrmoQ562D6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TrmoQ562D6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TrmoQ562D6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TrmoQ562D6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TrmoQ562D6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TrmoQ562D6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TrmoQ562D6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmoQ562D6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms