Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam228bQ497Q6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms