Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc10Q3TLI0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms