Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Xrn1P97789 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Xrn1P97789 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms