Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bop1P97452 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bop1P97452 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Bop1P97452 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Bop1P97452 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms