Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Epb41P48193 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Epb41P48193 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms