Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lama1P19137 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lama1P19137 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms