Protein–RNA interactions for Protein: O89019

Invs, Inversin, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InvsO89019 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
InvsO89019 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InvsO89019 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
InvsO89019 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
InvsO89019 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
InvsO89019 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InvsO89019 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InvsO89019 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InvsO89019 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InvsO89019 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InvsO89019 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InvsO89019 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InvsO89019 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InvsO89019 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
InvsO89019 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InvsO89019 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
InvsO89019 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
InvsO89019 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InvsO89019 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms