Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vamp4O70480 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms