Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BckdkO55028 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdkO55028 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdkO55028 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BckdkO55028 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms