Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bbip1J3QMK2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbip1J3QMK2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms