Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
6030445D17RikE9Q8F9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms