Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a3A2ACT7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms