Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933424G06RikA0A140LIP3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms