Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms