Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx6Q9ER75 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx6Q9ER75 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms