Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc46a3Q9DC26 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc46a3Q9DC26 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms