Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 380 ms