Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl27Q99N92 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl27Q99N92 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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