Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsun3Q8CCT7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsun3Q8CCT7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms