Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrn2Q6PHP6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrn2Q6PHP6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms