Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2surpQ6NV83 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms