Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg9aQ68FE2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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