Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam228bQ497Q6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms