Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms