Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf6Q3TWW8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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